یک درخت را در نظر بگیرید که از ریشه - تنه - شاخه - برگ - گل - ... تشکیل شده است یعنی از اگر از ریشه شروع کنیم و همین طور جلو بریم به برگها یا گلها میرسیم ، ریجستری در ویندوز هم یک ساختار درختی دارد ، البته در نگاه اول ممکنه برای شما عجیب و غیر قابل فهم باشد ،اما windows Explorer را در ویندوز در نظر بگیرید که از My Computer شروع شده بعد به درایوها میرسیم بعد شاخه ها یعد زیر شاخه ها .... تا نهایتا به فایلها میرسیم ساختار ریجستری نیزدقیقا چنین ساختاری را دارد.
هر شاخه اصلی با آیکون Folder نمایش داده می شود که به آنها اصطلاحا Hive نیز گفته می شود. هر شاخه خود می تواند شامل زیر شاخه هایی باشد تا نهایتا به متغیرها یا مقادیر برسند. در متغیرها است که اطلاعات واقعی رجیستری ذخیره می شود.