موضوع فارسی :شبیه سازی دینامیک مولکولی غشاء بیولوژیکی و
پروتئین های غشای با استفاده از ساختاری افزایش یافته
الگوریتم نمونه
موضوع انگلیسی :Molecular dynamics simulations of biological membranes and
membrane proteins using enhanced conformational
sampling algorithms
تعداد صفحه :17
فرمت فایل :PDF
سال انتشار :2016
زبان مقاله : انگلیسی
در این مقاله روش های مختلف نمونه گیری تایید افزایش یافته و صریح و روشن / حلال ضمنی / غشاء
مدل، مدل ها و همچنین برنامه های اخیر خود را به کاوش در ساختار و دینامیک غشاء و
پروتئین های غشای. شبیه سازی دینامیک مولکولی تبدیل به یک ابزار ضروری برای بررسی بیولوژیکی
مشکلات و موفقیت خود را متکی بر مدل های مولکولی مناسب همراه با نمونه برداری ساختاری کارآمد
مواد و روش ها. نمایندگی ضمنی از محیط حلال / غشاء تقریب منطقی به صریح و روشن است
مدل های تمام اتم، با توجه به تعادل بین هزینه های محاسباتی و دقت شبیه سازی. ضمنی
مدل را می توان به راحتی با ماکت تبادل روش دینامیک مولکولی ترکیب به کشف یک ساختاری گسترده تر
فضا از یک پروتئین است. سایر مدل مولکولی و روش های نمونه گیری ساختاری پیشرفته نیز
خلاصه مورد بحث. به عنوان نمونه های نرم افزار، مطالعات شبیه سازی اخیر glycophorin معرفی می کنیم، phospholamban،
پروتئین آمیلوئید، و دو لایه لیپیدی مخلوط و بحث در مورد دقت و بهره وری هر یک از شبیه سازی
مدل و روش. پروتئین غشایی: این مقاله بخشی از یک موضوع خاص تحت عنوان است. ویراستاران مهمان: J.C.
Gumbart و سرگئی نوسکوف.