پایان نامه بررسی روابط ژنتیکی ارقام و پایه‌های سیب با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

اختصاصی از یارا فایل پایان نامه بررسی روابط ژنتیکی ارقام و پایه‌های سیب با استفاده از نشانگر مولکولی SSR دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .

فرمت فایل : WORD , PDF

تعداد صفحات: 90

پایان نامه کارشناسی ارشد رشته بیوتکنولوژی کشاورزی (M.Se)

موضوع:
بررسی روابط ژنتیکی ارقام و پایه‌های سیب با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

فهرست مطالب:
عنوان    صفحه
چکیده:    1
مقدمه    2
فصل اول    3
بررسی منابع و کلیات    3
1-1- تاریخچه و گسترش سیب در جهان    4
2-1- درخت سیب و خواص بتانیکی آن    5
3-1- فرآورده‌های سیب    6
4-1- خواص دارویی سیب    6
5-1- ارزش غذایی سیب    7
6-1- پایه‌های سیب    8
1-6-1-پایه‌های بذری    8
2-6-1- پایه‌های رویشی(غیر بذری)    9
1-2-6-1-پایه‌های مالینگ    9
2-2-6-1- پایه های مالینگ مرتون    10
3-2-6-1-پایه های بوداگوسکی    11
7-1- زیست شناسی مولکولی    11
1-7-1- نشانگر    11
2-7-1- هدف از کاربرد نشانگر    11
3-7-1- انواع نشانگرهای ژنتیکی    12
1-3-7-1- نشانگرهای ریخت‌شناسی (مورفولوژیکی)    12
2-3-7-1- نشانگرهای سیتوژنتیکی    12
3-3-7-1- نشانگرهای ملکولی در سطح پروتئین    12
4-3-7-1- نشانگرهای مولکولی در سطح  DNA    13
5-3-7-1- انواع نشانگرهای DNA    14
الف) نشانگرهای DNA غیر مبتنی بر PCR                                   14
- تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (RFLP)     14
-  تعداد متفاوت ردیف‌های تکراری و ماهوارک‌ها (VNTR   & Minisatellites)     15
-  پویش ژنومی نشانه‌های هضم (RLGS)     15
ب) نشانگرهای DNA مبتنی بر PCR    15
4-7-1- ردیف‌های تکراری    17
1-4-7-1- ماهواره‌ها    18
2-4-7-1- ماهوارک‌ها    18
3-4-7-1- ریز ماهواره‌ها (میکروستلایت‌ها یا SSR)    19
5-7-1- چگونگی ایجاد میکروستلایت‌ها    20
6-7-1- خصوصیات نشانگرهای SSR    20
7-7-1- کاربردهای نشانگرهای SSR    21
8-7-1- مزایای ریز ماهواره ها    21
9-7-1- معایب ریز ماهواره‌ها    22
10-7-1- اساس چند شکلی در جایگاههای ریزماهواره    23
1-10-7-1-  مدل کراسینگ اور نا متقارن (UCO)     23
2-10-7-1- مدل سر خوردن پلیمراز هنگام همانند سازی(SSM)    24
8-1- واکنش زنجیره ای پلیمراز    24
1-8-1- اجزای واکنش PCR    24
1-1-8-1- آنزیم    24
2-1-8-1-مخلوط ذروکسی نوکلئوتید تری فسفات ( dNTPs )    25
3-1-8-1-  DNA الگو    25
4-1-8-1-  آغازگرها    25
5-1-8-1- بافرها و کلرید منیزیوم    26
2-8-1- عوامل مؤثر براختصاصی بودن واکنش PCR    26
1-2-8-1- غلظت مخلوط  PCR    26
2-2-8-1- دما    27
3-2-8-1- تعداد و طول سیکل    27
4-2-8-1- افزاینده های PCR    27
3-8-1- (TD-PCR) Touch Down PCR    27
4-8-1- PCR  آشیانه ای    28
9-1- الکتروفورز ژل آگارز    28
10-1- الکترفورز ژل پلی آکریل آمید    29
11-1- مروری بر تحقیقات انجام شده توسط نشانگر SSR    29
فصل دوم    31
مواد و روشها    31
1-2- مواد گیاهی    32
2-2- استخراج DNA    36
1-2-2- استخراجDNA به روش دلاپورتا    36
2-2-2- استخراج DNA به روش  CTAB    37
3-2- تعیین کیفیت نمونه های DNA    38
4-2- تعیین کمیت نمونه های DNA    39
5-2- PCR    39
1-5-2- اجزای واکنش  زنجیره‌ای پلیمراز    39
1-1-5-2- آغازگرها    39
2-1-5-2- آنزیم Taq DNA polymerase    40
3-1-5-2- بافر PCR    41
4-1-5-2- کلرید منیزیوم    41
5-1-5-2- dNTP    41
2-5-2- بهینه سازی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز    42
6-2- الکتروفورز فراورده های PCR    43
1-6-2- الکتروفورز افقی در ژل آگارز    43
2-6-2- الکتروفورز عمودی در ژل پلی آکریل آمید    43
1-2-6-2- تیمار شیشه‌ها    44
2-2-6-2- تزریق ژل    44
3-2-6-2- گرم نمودن ژل    45
4-2-6-2- واسرشته سازی محصولات PCR    45
3-6-2 رنگ آمیزی ژل    46
7-2- تجزیه و تحلیل داده ها    47
1-7-2- امتیازدهی باندها    47
2-7-2- تجزیه خوشه ای    48
3-7-2-تعیین اندازه باندها و الگوی نواربندی اختصاصی    48
فصل سوم    49
نتیجه گیری و بحث    49
1-3- نتایج استخراج DNA    50
2-3- بهینه سازی دمای اتصال آغازگرها    52
3-3- بهینه سازی روش PCR    52
4-3- بررسی نهایی نتایج حاصل از PCR    52
5-3- بررسی چند شکلی های SSR    54
6-3- بررسی و تحلیل روابط خویشاوندی بین ارقام    57
7-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای ارقام    60
7-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای ارقام    61
1-7-3- تعیین آللهای اختصاصی    61
2-7-3- الگوی نواربندی اختصاصی در ارقام    61
8-3- بررسی میزان خویشاوندی بین پایه ها    64
9-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای پایه ها    65
1-9-3- تعیین آللهای اختصاصی    65
فصل چهارم    68
نتیجه گیری کلی و پیشنهادات    68
نتیجه گیری کلی    69
پیشنهادات    70
ضمائم    71
منابع و مآخذ:    75
 

چکیده:
ثبت و شناسایی ارقام و پایه های گیاهی و تعیین رابطه ژنتیکی بین آنها مستلزم دسترسی به روشهای دقیق و قابل تکراری که از شرایط محیطی متأثر نباشد، می باشد. روشهای سنتی تعیین هویت بر اساس مشاهده ظاهری درخت و میوه است.  با توجه به اینکه بسیاری از خصوصیات ظاهری تحت تأثیر عوامل محیطی قرار می گیرند، این روش قابل اعتماد نیست.
با استفاده از نشانگرها در سطح ملکول DNA می توان اطلاعات دقیقی از ژنوم گیاهان بدست آورد.از جمله نشانگرهای معتبر در بررسی ژنوم سیب، نشانگر SSR است که بدلیل تکرارپذیری بالا، ایجاد الگوی باندی نسبتاً ساده و توارث همبارز در بررسی تنوع ژنتیکی و شناسه دار کردن ارقام و  پایه های سیب کارایی بالایی دارد.
در بررسی حاضر از 5 جفت نشانگر پلی مورفیک SSR بر روی 24 رقم و پایه سیب بمنظور تهیه شناسنامه ژنتیکی برای بعضی از ارقام و پایه ها و همچنین تعیین رابطه ژنتیکی بین آنها استفاده شد. نمونه های برگی از کلکسیون سیب جمع آوری و DNA آنها استخراج شدند و سپس با استفاده از نشانگرهای اختصاصی SSR مورد تکثیر قرار گرفتند.  پس از الکتروفورز عمودی در دستگاه توالی یاب  DNA در ژل پلی آکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره در مجموع 52 آلل پلی مورفیک در 5 لوکوس ریزماهوار ( میانگین 4/10 در هر لوکوس) شناسایی شدند.  تجزیه کلاستر بطور جداگانه برای ارقام و پایه ها بر اساس حضور و عدم حضور باند با استفاده از برنامه NTSYS و ضریب تشابه Dice  مبتنی بر UPGMA انجام گرفت.  دندوگرام حاصل از ارقام نشان داد که ارقام مورد بررسی تنوع زیادی داشتند و در 6 کلاستر جای گرفتند و سیبهای گلاب مورد بررسی توسط این 5 جفت نشانگر از هم تفکیک شدند.  در دندوگرام پایه ها شباهت دو پایه MM111و  MM106 مشاهده گردید.
با استفاده از 3 آغازگر (CH01H01,02B1,CH02B10) باندهای اختصاصی در ارقام (24 رقم) مشاهده شد. همچنین اگوی نواربندی اختصاصی برای بعضی از ارقام در هر آغازگر بدست آمد.  در نهایت این 5 آغازگر توانستند آللهای اختصاصی مربوط به پایه ها را تعیین کنند.



مقدمه   
مهمترین درختان میوه ای که در مناطق معتدله و سردسیری به صورت اهلی درآمده‌اند در خانواده گلسرخیان  قرار دارند مانند سیب، گلابی، آلوچه، گیلاس و..... .  سیب از نظر اقتصادی بیشترین اهمیت را در بین محصولات درختی مناطق معتدله و سردسیری دارد و تعداد زیادی از ارقام تجاری آن به دلیل گرده‌افشانی باز، تلاقی‌های کنترل شده و یا تلقیح موتاسیون سوماتیکی با ارقام سازگار، قابل استفاده در برنامه‌های اصلاحی اند. یک مشکل قابل توجه در صنعت سیب و فراورده های آن تعیین هویت ارقام آن می‌باشد. روشهای سنتی تعیین هویت بر اساس مشاهده ظاهری درخت ومیوه است. با توجه به اینکه بسیاری از خصوصیات ظاهری تحت تأثیر عوامل محیطی قرار  می گیرند، این روش، قابل اعتماد نیست. روش دیگر برای تعیین هویت ارقام استفاده از نشانگر می باشد. استفاده از نشانگرها در سطح مولکول DNA  دقیق ترین روش بررسی است که جزئیات بیشتری از ژنوم ارقام سیب را ارائه می‌دهد. ازجمله نشانگرهای معتبردر بررسی ژنوم سیب، نشانگر  SSRاست که به دلیل قابلیت تکرارپذیری بالا، ایجاد الگوی باندی نسبتاً ساده و توارث هم بارز، در بررسی تنوع ژنتیکی و شناسه دار کردن ارقام سیب کارایی بالایی دارد. در این تحقیق با استفاده از نشانگرهای منتخب SSR تنوع ژنتیکی 29 رقم و پایه سیب و امکان دستیابی به نوارهای اختصاصی DNA در هر یک از ارقام و پایه ها مورد بررسی قرار گرفت.



فصل اول
بررسی منابع و کلیات
 
1-1- تاریخچه و گسترش سیب در جهان
سیب اهلی) ( Malus domestica Borkh از گونه‌های وحشی موجود در آسیا و اروپا به دست آمده است و قدمت کشت و پرورش آن به سالهای ماقبل تاریخ می‌رسد. طبق مدارک باقیمانده موجود در حدود 2000 سال قبل از میلاد، درختان سیبی که از جنگل‌ها انتخاب و به وسیله بذر ازدیاد شده بودند، در دهکده‌های ماقبل تاریخ کشت می‌شده اند. طبق کشفیات اخیر، ساکنین اطراف دریاچه‌های شمال اروپا و قسمتی از سوئیس، از سیب خشک‌کرده به عنوان غذا استفاده می‌کردند. بقایایی از سیب و گلابی خشک شده در بین آثار باقیمانده از این دهکده‌های ابتدایی در این نواحی مؤید این نظریه است. مدارک نوشته شده موجود حاکی از این است که در سالهای 600 قبل از میلاد یا حتی جلوتر از آن پرورش سیب در یونان متداول بوده است. از زمان تئوفراستوس دانشمند گیاهشناس روم قدیم (حدود 225 قبل از میلاد) ارقام متعددی از سیب در رم مورد ازدیاد قرار گرفته بود. سیب از بخش غربی آسیا و جنوب روسیه (قفقاز) و اروپا ابتدا به صورت بذر و دانه و بعدها پاجوش و پیوند در اروپا و آسیا منتشر گردیده است. بذور اولیه و هتروژن سیب منشأ واریته‌های جدیدی شدند که افراد علاقمند و با دقت، بهترین آنها را انتخاب و به طریق پاجوش یا پیوند ازدیاد کردند. با وجود قدمت کاشت سیب و شناختی که در ایران زمین به این درخت زیبا و میوه مطلوب وجود داشته و در ادبیات ما از آن بسیار یاد شده است، سیب تا این اواخر هیچ وقت به عنوان یک محصول اقتصادی و تجاری تلقی نشده است. این وضع در اروپا نیز تا اواسط قرن 19 و اوایل قرن بیستم وجود داشته است. بعد از احداث راههای جدید ارتباطی بین مراکز عمده تولید و بازارهای مصرف و بالارفتن قدرت خرید مردم و پی‌بردن به محسنات بهداشتی و غذایی آن، و بالاخره با به وجود آمدن صنایع تبدیلی، سیب به صورت یک محصول عمده اقتصادی در جهان شناخته شد.  در ایران این تحول خیلی دیر شروع شد. در واقع در طول سی‌سال اخیر بود که سیب به صورت تجاری در ایران کاشته شد و محصول آن به بازارها عرضه گردید (18).



2-1- درخت سیب و خواص بتانیکی آن
درخت سیب از خانواده گلسرخیان و جنس مالوس( Malus) و دارای ارقام مختلفی می‌باشد (13).   350 گونه مختلف سیب در دنیا شناخته شده که مهمترین آنهاM. sylvestris Mill ¸ M.Pumila Mill                 Borkh M.domestica می‌باشند. اکثر ارقام اهلی و تمام پایه‌های پاکوتاه سیب که از طریق غیرجنسی تکثیر می‌شوند به M. pumila Mill تعلق دارند (7).  منشاء  پیدایش سیب  اهلی (M.domestica) نامشخص است گرچه عده‌ای از  گیاهشناسان معتقدند که  سیب  اهلی از M. pumila Mill مشتق  شده  است (45).  عدد پایه کروموزومی سیب برابر 17، (n=17) می‌باشد. درخت سیب تابع آب و هوای سرد معتدل با نیاز سرمایی متوسط است. خاک مناسب برای پرورش آن، رسی شنی حاصلخیز با عمق کافی و pH خنثی است. ریشه گیاه با توجه به نوع بافت خاک، واریته و اثرات متقابل عوامل محیطی، می‌تواند چندین متر در خاک فرو رود. بیشترین رشد ریشه‌ها در بهار از زمان بازشدن جوانه‌ها تا خرداد ماه است.  ریشه مطلوب در عمق و شعاع متعادل و متناسبی منشعب می‌شود و تمام حجم خاک در دسترس خود را برای به دست آوردن آب و مواد غذایی مورد بهره‌برداری قرار می‌دهد.  ساقه درخت، قابلیت انعطاف‌پذیری و پرورش نهایی به انواع فرم‌ها را دارد (13).  بعضی از ارقام سیب تمایل بسیار به تولید پاجوش دارند. رنگ پوست شاخه های درخت سیب از زرد تا قرمز متغیر و اکثراً قهوه ای است. تاج  درخت متنوع، در بعضی ارقام چتری و درهم و در بعضی دیگر باز، کم شاخه، هرمی، مستطیلی، استوانه ای با شاخه های عمودی موازی یا بینابین است.  زاویه شاخه های اصلی با تنه در بعضی ارقام قائمه ودر بعضی دیگر تنگ و حاده است. ریشه نیز بر حسب گونه ها وارقام از رشد و فرم متفاوتی برخوردار است. ریشه اکثریت درختان از بذر بوجود آمده گونه سیب معمولی (M.communis) در  عمق 15 سانتی متری تا 20/ متری قرار دارند. حدود گسترش افقی ریشه ها بر حسب ارقام و چگونگی شرایط خاک از چند سانتی متر تا چند متر است. ریشه سیب به هوا و اکسیژن زیاد نیاز دارد.  جوانه های درخت سیب به دو نوع جوانه برگ و گل تقسیم می شوند. جوانه های برگی همه ساله در طول شاخه های جوان در بغل برگها در بهار بوجود می آیند و جوانه های گل همیشه در انتهای شاخکهای کوتاه که به سیخک  معروفند ظاهر می شوند. طول این شاخکها بر حسب نوع رقم، سن ، طول عمر باردهی درخت و مواد غذایی حدود    15- 10 سانتی متر است. درخت سیب بیشتر از سایر درختان میوه به باردهی متناوب تمایل داردوچنانچه در یکسال  بار زیادی داشته باشند، در سال بعد بی بار یا کم بار خواهند شد. ولی این قاعده کلی نیست و ارقامی پیدا می شوند که همه ساله بار متعادلی می آورند. تاج درختان سیب از 2 الی 10 متر گسترش و 5/1 الی 8 - 7 متر ارتفاع دارد(18 ).

3-1- فرآورده‌های سیب
محصولاتی که در حال حاضر از سیب به دست می‌آیند عبارتند از آب سیب، کنستانتره، شهد سیب، کمپوت، انواع مربا، سس سیب، سیدر ،  سرکه ترشی و الکل.  علاوه بر محصولات مزبور می توان سیب را به قطعات کوچک بریده و پس از خشک کردن بدون بیم از فساد آن، مدتهای طولانی آنها را نگهداری نمود.  این محصول مورد استفاده ارتشهای دنیا است.   در آمریکا پنج نوع فرآورده اصلی از سیب تولید می‌شود که شامل آب سیب، سس سیب، کمپوت سیب، برگه سیب و سیب یخ‌زده است. آب سیب و سس و کمپوت آن بیش از سایر فرآورده‌های دیگر تولید می‌شود و مقدار تولید این فرآورده‌ها نیمی از کل تولیدات آنرا  تشکیل می‌دهد. مقداری از سیب تولیدی به مصرف تهیه سرکه، ژله، کره سیب و ورقه های تازه می‌رسد. همچنین مقدار کمی نیز به شراب، اسانس، سیب کامل تنوری، حلقه سیب و شهد سیب تبدیل می‌شود (10). صنایع تبدیلی سیب در دنیا از ارزش افزوده بسیار بالایی در اقتصاد برخوردارند و حجم مبادلات و کالاهای ساخته شده از سیب به تنهایی به میلیاردها دلار بالغ می‌شود.  متأسفانه در ایران به این صنایع بسیار اندک توجه شده و هنوز حجم کار آنها بسیار کوچک است (18).

4-1- خواص دارویی سیب
سیب ضدعفونی کننده دهان است و اسید اوریک و دیگر سمومی که در بدن جمع شده‌اند را حل کرده و غدد بزاق دهان و شیره معده را تقویت می‌کند.  سیب سنگ کیسه صفرا و کلیه‌ها را حل می کند و تب حاصل از گریپ و سرماخوردگی را فرو می‌نشاند. ضد وباست و برای امراض حصبه‌ای و اسهال خونی و ورم امعاء بسیار نافع است و مانع سوءهاضمه بوده و بدین ترتیب کار معده را تنظیم می‌کند. از آرد سیب برای جلوگیری از خون دماغ و رفع سموم  (اسید اوریک، کلسترول) استفاده می‌شود.  سیب برای درمان بیماریهای کبدی، معدی، مجاری ادرار و سینه درد نیز نافع است و به دلیل داشتن فسفر موجب تقویت اعصاب و مغز می‌شود.  سیب برای مبتلایان به مرض مفاصل زیاد تجویز می‌شود. از سیب به عنوان پماد زخم‌ها استفاده می‌شود و عقیده بر این است که کلمه پماد از کلمه Pome که به معنی سیب است مشتق شده است.  از سیب برای تهیه مرهم به منظور آرام کردن درد در مواقعی که ضربه‌ای به چشم وارد شده و نیز جهت تخفیف درد گوش استفاده می‌گردد. دم کرده شکوفه درخت سیب انواع سرفه را آرام می‌نماید. سیب مقوی دل و دماغ و جگر بوده و برای خفقان و تنگی نفس مفید است. شربت سیب برای دفع سموم و تفریح قلب بسیار مؤثر است (2 و4).

دانلود پایان نامه تجزیه ژنتیکی مقاومت به بیماری بلاست در ارقام برنج بروش دیالل

اختصاصی از یارا فایل دانلود پایان نامه تجزیه ژنتیکی مقاومت به بیماری بلاست در ارقام برنج بروش دیالل دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .

فرمت فایل : word(قابل ویرایش)

فهرست مطالب :
فصل اول (مقدمه و بررسی نوشته ها)
1-1 مقدمه.....................................................................................................................................
1-2 بررسی منابع............................................................................................................................
1-2-1 گیاه شناسی و ریخت شناسی برنج.......................................................................................
1-2-2 مشخصات ژنتیکی گیاه برنج...............................................................................................
1-3 اصلاح برنج ...........................................................................................................................
1-4 تاریخچه بلاست.....................................................................................................................
1-4-1 عامل بیماری بلاست...........................................................................................................
1-4-2 چرخه بیماری.....................................................................................................................
1-4-3 عامل بیماری .....................................................................................................................
1-5 روشهای کنترل بیماری بلاست................................................................................................
1-6 نژادهای فیزیولوژیک عامل بیماری.........................................................................................
1-7 ژنتیک مقاومت به بیماری.......................................................................................................
1-8 اثر متقابل ژن در برابر ژن........................................................................................................
1-9 بررسی نوشته ها......................................................................................................................
فصل دوم (مواد و روشها)
2-1 مواد گیاهی مورد استفاده و پاتوژنها.........................................................................................
2-2 محیط کشت اختصاصی RBAS...........................................................................................
2-3 تهیه سوسپانسیون اسپور...........................................................................................................
2-4 آماده سازی گیاهان آزمایشی .................................................................................................
2-5 مایة زنی بلاست برگ.............................................................................................................
2-6 اندازه گیری اجزای مقاومت به بیماری و سنجش بیماری..........................................................
2-7 بررسی مزرعه ای ...................................................................................................................
2-7-1 نحوة دورگ گیری برنج....................................................................................................
2-8 تجزیه های آماری..................................................................................................................
2-8-1 آزمون معتبر بودن فرضیات هیمن........................................................................................
2-8-2 تجزیه گرافیکی .................................................................................................................
2-8-3 برآورد اجزای واریانس......................................................................................................
2-8-4 میانگین درجه غالبیت.........................................................................................................
2-8-5 نسبت ژنهایی که دارای اثرات مثبت و منفی در والدین هستند..............................................
2-8-6 نسبت ژنهای غالب به مغلوب در والدین..............................................................................
2-8-7 جهت غالبیت ....................................................................................................................
2-8-9 وراثت پذیری ....................................................................................................................
2-8-10 تجزیه واریانس قابلیتهای ترکیب پذیری............................................................................
2-8-10-1 محاسبه اجزای واریانس ژنتیکی....................................................................................
فصل سوم (بحث و نتایج)
3-1 وضعیت والدین و نتاج F1 آنها...............................................................................................
3-2 مطالعات ژنتیکی و برآوردهای وراثت پذیری و اثرات ژنی برای خصوصیات بیماری بلاست برگ در طرح دیالل بروش هیمن....................................................................................................
3-3 بررسی قابلیت ترکیب پذیری صفات مهم بیماری....................................................................
3-4 روشهای اصلاحی ..................................................................................................................
3-5 مطالعه و ارزیابی مقاومت بیماری بلاست در اراقام مختلف برنج و F1 ها در شرایط گلخانه ای و مزرعه ای....................................................................................................................................    

فهرست جداول 
3-1 تجزیه واریانس  و تخمین ضرایب تنوع ژنتیکی (GCV) و فنوتیپ (PCV) و متوسط بازدهی ژنتیکی.........................................
3-2-1 آزمون های فرض برای صفات مورد بررسی در بیماری بلاست برنج در طرح دیالل بروش هیمن..............................................
3-2-2 برآورد اجزاء ژنتیکی در مقابل نژاد IA-89 برای خصوصیات مهم بیماری بلاست برنج در طرح دیالل بروش هیمن..................
3-2-2 برآورد اجزاء ژنتیکی در مقابل نژاد IA-82 برای خصوصیات مهم بیماری بلاست برنج در طرح دیالل بروش هیمن..................
3-2-2 برآورد اجزاء ژنتیکی در مقابل نژاد IA-90 برای خصوصیات مهم بیماری بلاست برنج در طرح دیالل بروش هیمن..................
3-2-3 آزمون t برای پارامترهای ژنتیکی (E, h2,F, H2,H1, D) صفات مورد بررسی در بیماری بلاست برنج در طرح 5*5 دیالل به روش هیمن........................................................................................................................................................................................
3-2-4 وضعیت درجه غالبیت و نسبت فراوانی های آلل غالب به مغلوب در اجتماع والدین در تلاقی دی آلل 5*5...............................
3-3-1 تجزیه واریانسی قابلیت های ترکیب پذیری و نسبت msGCA/msSCA برای صفات مورد بررسی بیماری بلاست برنج در طرح دیالل به روش گریفینگ.............................................................................................................................................................
3-3-2 برآوردهای مقادیر قابلیت پذیری عمومی (GCA) ارقام برنج برای صفات مورد بررسی  بیماری بلاست در طرح دیالل بروش گریفینگ....
3-3-3 برآوردهای مقادیر قابلیت ترکیب پذیری خصوصی ارقام برنج برای صفات مورد بررسی  بیماری بلاست برگ برنج در طرح دیالل بروش گریفینگ........................................................................................................................................................................
3-3-4 مقادیر قابلیت ترکیب پذیری عمومی و خصوصی، افزایشی و غالبیت برای صفات مورد بررسی بیماری بلاست برنج در مقابل سه نژاد IA-90, IA-89, IA-82 در طرح دیالل به روش گریفینگ................................................................................................
3-3-5: برآوردهای مقادیر ضرایب همبستگی بین GCA برای کلیه صفات مورد بررسی بیماری بلاست و همبستگی ساده برای 5 والد طرح................................
3-5-1 تجزیه واریانس والدین و اثر متقابل نژاد های IA-89, IA-82, IA-90 با ژنوتیپ والدین در شرایط گلخانه ای....................
3-5-2 تجزیه واریانس F1 ها و اثر متقابل سه نژاد IA-82, IA-89, IA-90 در شرایط گلخانه ای..................................................
3-5-3 تجزیه واریانس سطح زیر منحنی توسعه بیماری در خزانه بلاست برنج......................................................................................
3-5-4  واکنش ارقام مورد آزمایش در مقابل نژاد IA-82 برای صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای..........................................
3-5-4 واکنش ژنو تیپ های مورد آزمایش در مقابل نژاد IA-89 برای صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای..............................
3-5-4 واکنش ژنو تیپ های مورد آزمایش در مقابل نژاد IA-90 برای صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای..............................
3-5-5 مقایسه میانگین دانکن برای صفات مورد بررسی  در مقابل سه نژاد IA-90  IA-82, IA-89  در سطح 1%............................
3-5-7 همبستگی بین صفات تیپ آلودگی، تعداد لکه، درصد آلوده سطح برگ، اندازه لکه، دوره کمون و قابلیت اسپورزایی در مقابل نژاد IA-82 در شرایط گلخانه ای......................................................................................................................................................
3-5-8 همبستگی بین صفات تیپ آلودگی، تعداد لکه، درصد آلوده سطح برگ، اندازه لکه، دوره کمون و قابلیت اسپورزایی در مقابل نژاد IA-89 در شرایط گلخانه ای.............................................................................................................................................
3-5-9 همبستگی بین صفات تیپ آلودگی، تعداد لکه، درصد آلوده سطح برگ، اندازه لکه، دوره کمون و قابلیت اسپورزایی در مقابل نژاد IA-90 در شرایط گلخانه ای.............................................................................................................................................
3-5-10 قابلیت اسپورزایی(تعداد اسپوردر واحد وزن تر)برای ارقام و هیبریدهای برنج مایه زنی شده با نژاد های 90-IA و IA-89 و IA-82..............................................................................................................................................................................................
3-5-11 سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست برگ ارقام والدی و F1 های مورد بررسی در خزانه بلاست برنج................................
3-5-12 مقایسه میانگین دانکن AUDPC در خزانه بلاست در سطح 1%............................................................................................
3-5-13 همبستگی بین صفات مورد بررسی والدین در مقابل سه نژادIA-90, IA-89,IA-82 در شرایط گلخانه ای.........................
3-5-14  همبستگی بین صفات مورد بررسیF1 ها در مقابل سه نژاد IA-90, IA-89, IA-82 در شرایط گلخانه ای.......................
3-5-15 همبستگی بین صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای با سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در خزانه بلاست در مقابل نژاد IA-90.......................................................................................................................................................................................
3-5-16 همبستگی بین صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای با سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در خزانه بلاست در مقابل نژاد IA-89.......................................................................................................................................................................................
3-5-17 همبستگی بین صفات مورد بررسی در شرایط گلخانه ای با سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در خزانه بلاست در مقابل نژاد IA-82.......................................................................................................................................................................................    57

فهرست نمودار 
نمودار 3-2-1 صفت تیپ آلودگی در مقابل نژاد IA-90...........................................................................
نمودار 3-2-2 صفت تعداد لکه در مقابل نژاد IA-90 .................................................................................
نمودار 3-2-3 صفت درصدآلودگی سطح برگ در مقابل نژاد IA-90 .................................................
نمودار 3-2-4 صفت اندازه لکه در مقابل نژاد IA-90 ................................................................................
نمودار 3-2-5 صفت دوره کمون در مقابل نژاد IA-90.............................................................................
نمودار 3-2-6 صفت تیپ آلودگی در مقابل نژاد  IA-89.........................................................................
نمودار 3-2-7 صفت تعداد لکه در مقابل نژاد  IA-89................................................................................
نمودار 3-2-8 صفت درصد آلودگی سطح برگ در مقابل نژاد  IA-89...............................................
نمودار 3-2-9 صفت اندازه لکه در مقابل نژاد  IA-89................................................................................
نمودار 3-2-10 صفت دوره کمون در مقابل نژاد  IA-89.........................................................................
نمودار 3-2-11 صفت تیپ آلودگی در مقابل نژاد  IA-82........................................................................
نمودار 3-2-12 صفت تعداد لکه در مقابل نژاد  IA-82..............................................................................
نمودار 3-2-13 صفت درصد آلودگی سطح برگ در مقابل نژاد  IA-82...............................................
نمودار 3-2-14 صفت اندازه لکه در مقابل نژاد  IA-82.............................................................................
نمودار 3-2-15 صفت دوره کمون در مقابل نژاد  IA-82.........................................................................
نمودار 3-5-1 سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در پنج رقم والد و ده F1 در خزانه بلاست....
نمودار 3-5-2 سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در پنج رقم والد در خزانه بلاست..................
نمودار 3-5-3 سطح زیر منحنی توسعه بیماری بلاست در ده F1 در خزانه بلاست...........................

فهرست منابع:
- آمار و فن آوری اطلاعات- بانک اطلاعات زراعت-1382
- ارزانی، ا، 1383. اصلاح گیاهان زارعی (ترجمه)، انتشارات دانشگاه صنعتی اصفهان، 606 صفحه.
- اخوی زادگان,م,1354.مقایسه اثرچند قارچ کش علیه بلاست برنج.نشریه شماره1و2,جلد12,بیماریهای گیاهی.
- امان زاده، م ، 1383. مطالعه بیماری زایی جدایه های قارچ Prycularia grisea عامل بیماری بلاست برنج و ارزیابی مقاومت ارقام در مازندران پایان نامه فوق لیسانس گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، 115 صفحه.
- اهدائی،ب،70 13. اصول اصلاح نباتات، انتشارات  شهید چمران اهواز، 455 صفحه.
- بهداد، ا، 1377. عوامل بیماری زا و بیماری های مهم گیاهی ایران، نشریاد بود، 472 صفحه.
- بهرامی، م، 1375. شناسایی نژاد های فیزیولوژیک قارچ Pyricularia oryzae عامل بیماری بلاست برنج در مازندران، انتشارات معاونت موسسه تحقیقات برنج کشور- مازندران،9صفحه.
- بهرامی، م. ایزدیار،م, 1377. معرفی نژادهای جدید فیزیولوژیک قارچyricularia oryzae  عامل بیماری بلاست برنج در مازندران خلاصه مقالات سیزدهمین کنگره گیاهپزشکی ایران,  73 صفحه.
- جوان نیک خواه،م، 1380. تحقیق روی تنوع ژنتیکی جمعیت Magnaporthe grisea عامل بیماری بلاست برنج، با استفاده از خصوصیات مولکولی, بیماری زایی و سازگاری رویشی دراستان گیلان،رساله دکتری گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی،دانشگاه تهران، 175 صفحه
- خدابنده، ن, 1371، غلات. انتشارات دانشگاه تهران 506 صفحه.
- عبد میشانی،س، بوشهری، ع،1376. اصلاح نباتات تکمیلی، موسسه انتشارات دانشگاه تهران، جلد اول، 320 صفحه.
- فرشادفر،ع، 1377. کاربرد ژنتیک کمی در اصلاح نباتات، انتشارات دانشگاه رازی، کرمانشاه، جلد اول، 527 صفحه.
- کیانوش، غ،1374. بررسی اختصاصات ژنتیکی و ترکیب پذیری ارقام برنج به روش دیالل،پایان نامه کارشناسی ارشد گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، 185 صفحه.
- مامقانی،ر،1373. دورگ گیری در گیاهان زارعی (ترجمه)، انتشارات. دانشگاه شهید چمران اهواز,154 صفحه.
- مؤمنی، ع، 1381. تجزیه ژنتیکی و مولکولی مقاومت برنج به بلاست با استفاده از نشانگرهای دفاعی خاص، رساله دکتری گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، 180 صفحه.
- نصیری، م، 1376.مرفولوژی و مراحل رشد برنج، انتشارات مؤسسه تحقیقات برنج کشور معاونت مازندران- آمل،9صفحه.
- نوروزی، م، عارفی، ح، 1376. مرفولوژی و گیاه شناسی ارقام محلی و اصلاح شده برنج انتشارات مؤسسه تحقیقات برنج کشور معاونت مازندران آمل،10صفحه.
- یزدی صمدی، ب، عبدمیشامی، س، 1371. اصلاح نباتات، انتشارات مرکز دانشگاهی، 282 صفحه.
- یوسف نیا، ع، 1379. بررسی تنوع ژنتیکی در ارقام برنج بومی و هیبرید، پایان نامه کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی واحد اردبیل،183صفحه.


Ahn, S.W & S. H. Ou. 1982. Epidemiological implications, of the spectrum         of resistance to rice blast. Phytopathology 72:282-284.

Bonman, J. M., Estrada, B. A & Bandong, J. M. 1989. Leaf and neck blast resistance in tropical lowland rice cultivars. Plant Didease.73:388-390.

Camron, P. F. 1994. The newly recognized family magnaporthaceae and its relationship system Ascomycetum 13:25-42.

Fehrw. R. 1987. Principles of cultivar development. V0L22. Mac millan publishing company 761 PP.

Goto, K. 1955. History of the blast disease and changes in methods of control. Agricultural Improvement Bureau ministry of Agriculture and Forestry Japan 5:1-2[ja., as cited in Ou, 1983]                                                                   

Goto, K. 1965a. Estimating losses from rice blast in Japan. In: the rice blast Disease. Baltimore, Maryland, John Hopkins. 195-202 PP.

Griffing, B. 1956b. Concept of general and specific combining ability in relation to diallel crossing systems, Aust. J. Biol. Sic. 9:463-493.

Hayman, B. I. 1954. The analysis of variance of diallel tables. Biometrics . 10:235-244.

Hwang, B.K, Y.G. koh & H. S. Chung. 1987, Effects of adult- plant resistance on blast severity and yield of rice. Plant Disease. 71:1035-1038.

 International rice blast project statement of Intent.NCSU.                               http:// WWW.CALS.NCSU.EDU/FUNGAL GENOMICS/INT-RICE.HTML                                   

Inukai, T, Nelson, R. J. Zeigler, R. S, Sarkarung, Bonman. M.,1994. Allelism of blast resistance gene in near-isogenic line of Rice Pathology 84:1278-1283.

Jinks, J. L and B.I. Hayman, 1953. The analysis of diallel crosses. Maize Genetics News Letter. 27:48-54.

Kato, H & T. Yamaguchi. 1982. The perfect state of Pyricularia oryzae Cav. From rice plants in culture. Annales of Phytopathological Society of Japan
     48:607-612.

Kawakami, T. 1901. On the rice blast diseases. J. Sapporo Soc. Agric& Forestry, Japan. 2:1-47. [as cited in Sngh 1997]  
 KIM, C.K & R. Yoshino 2000. Sporulation of Pyricularia grisea at different growth stages of rice in the field. Plant pathological. J. 16:147-150.

Kiyosawa. S. 1965. Studies on inheritance of resistance of rice varieties to blast. Inheritance of resistance of the Zenith type varieties of rice to the blast fungus. Japan. J. Breed. 16:27-36.

Kiyosawa. S. 1968. Studies on inheritance of resistance of rice varieties to blast. Inheritance of resistance of variety PiNo.1 of rice to the blast fungus. Japan. J. Breed. 16:243-250.

Kiyosawa, S.1972. Genetics of blast resistance in Rice breeding:203-225 PP.

Lai H.X, M. A. Marchetti & H.D. Peterson. 1999. Comparative slow blasting rice grown under upland and flooded blast nursery culture. Plant Dis  83: 681-684.

Mackill, D. J. & J. M. Bonman. 1992. Inheritance of blast resistance in near-isogenic lines of rice. Phaytopathology 82:746-749.

Masao,Y, and Shigehisa, K,1970, Inheritance of blast resistance of the rice variety, toride1, selected from the cross Norin8 TKM.1 national institute of agricultural sciences, Hiratsuka 254, Japan .J. Breeding.20:129-132.

Niizeki, H. 1960. On a gene for resistance to Pyricularia oryzae in a japans rice variety. Aichi-Asahi. Hort. Agr, 35: 1321-1322. (in Japanes)

Ou, S. H. 1985. Rice diseases (2nd edn.). Commonwealth Agric. Bureaux. 380 PP.

Pohlman,1987, Breeding fild crops. Third edition Van nostrand Rein hold. New York 356-358 PP.                                                                                                           

Pinnschmidt, H.O., T.S. Peng, J.M. Bonman & J Kranz. 1993. A new assessment key for leaf blast (BL). IRRN 18:145-146

Robert, E. H & H .Eleanor. 1990. Rice: then & now, IRRI publication          losBanes, languna 44PP.

Rosman, A. Y. R. J. Howard & B. Valent. 1990.  Pyricularia grisea, the correct name for the rice blast disease fungus. Mycologia 82:509-512.                                                                                     

Scott, D. H, Amir, M. H. Ibrahim, Marie A.C.langham. 2000. Plants science Dep. South Dakata State unit, Brookings, SD57007.

Singh, B. D. 1990. Plant Breeding: Principles and Methods. MYS. 356-368 PP.

Shaner, G & R. E. Finney. 1977. The effect of nitrogen fertilization on the expression of slow-mildewing in Knox wheat Phytopathology. 67:1051-1056.

Shigehisa, k, Inheritance of resistance of rice variety piNo.1 to the blast fungus, national institute of agricultural sciences 9-16 PP.

Shigehisa, k,1969, inheritance of blast – resistance in west Pakistani Rice variety,  Pusur, national institute of agricultural sciences, Hiratsuka 254, Japan. Breeding.19:127-128.

Shigehisa, K, and V.V.S. murty, 1969, the in heritance of blast– resistance in Indian rice variety, HR-22; National Institute of Agricultural sciences, Hiratsuka 254 PP.

Shigehisa, K, 1966, inheritance of resistance of the rice variety PiNo.4 to blast national institute of Agricultural sciences, Hiratsuka

Venkataswamy. T. 1964. Inheritance of resistance in rice to three races of the blast fungus. Rice Genetics and cytogenetics, Elsevier publishing company,    273 PP.

Yeh, W.H. & Bonman, G.M 1986. Assessment of partial resistance to Pyricularia oryzae in six rice cultivars. Plant pathology 35:319-323.

Woo, S. S. 1965. Some experimental studies on the inheritance of resistance and susceptibility to rice leaf blast disease, Pyricularia oryzae Cav. Bot. Bull. Acad. Sinica, 6:208-217.

Yoshida. S. 1981. Fundamentals of Rice crop science. IRRI, 269 PP.

Zeigler, R. S. Thome, J., Levy, M., & Correa-Victoria, F. 1994. Lineage exclusion: A proposal for linking blast population analysis to resistance breeding. In: Rice Blast Disease. R. S. Zeigler, S. A. Leong, P. S. Teng, (eds). Commonwealth Agricultural Bureau International, Wallingford, UK.        

چکیده:
به منظور بررسی درجه نسبی مقاومت ارقام برنج به آلوده Pyricularia grisea saa  عامل بیماری بلاست برنج، و تعیین منحنی پیشرفت بیماری، مطالعات ژنتیکی و برآوردهای وراثت پذیری و اثرات ژنی و بررسی قابلیت ترکیب پذیری در دو آزمایش جداگانه توسط پنج رقم والد برنج با استفاده از طرح دیالل 5*5 در قالب طرح بلوک کامل تصادفی در ایستگاه تحقیقات برنج آمل و طی سالهای 83-1381 به اجرا درآمد. نتایج حاصل از آزمایشات حاکی از وجود تفاوت معنی دار بین ارقام مورد بررسی برای صفات تیپ آلودگی، تعداد لکه، اندازه لکه، درصد سطح آلوده برگ، دوره کمون و قابلیت اسپورزایی رقم طارم محلی بهمراه تلاقی (نعمت/طارم محلی) در گروه حساس و ارقام نعمت و سان هوان ژان-2 و ترکیبات هیبریدی حاصل از این دو والد در گروه مقاوم به بیماری بلاست دسته بندی شدند و منحنی پیشرفت بیماری بلاست در خزانه بلاست برنج در گروه اول بیشتر بوده است. نتایج حاصل از تجزیه هیمن برای صفات مورد بررسی در مقابل نژادهای
 IA-90, IA-82, IA-89 نشان دهنده سهم بالای اثرات افزایشی ژنی در کنترل صفات تیپ آلودگی، درصد سطح آلوده برگ و سهم بالای اثرات غالبیت در کنترل صفات دوره کمون، اندازه لکه و تعداد لکه در ارقام والد و F1 ها بوده است. در تجزیه گریفینگ میانگین مربعات مربوط به GCA و SCA بجز صفات مساحت لکه و دوره کمون در پاتوژن IA-90 ، بقیه صفات در دونژادIA-82, IA-89 در سطح آماری 1% و 5% معنی دار بوده است، واریته طارم محلی دارای بالاترین قابلیت ترکیب پذیری عمومی برای پنج صفت مورد مطالعه بیماری بلاست در شرایط گلخانه ای بوده است. با توجه به نسبت GCA/SCA در صفات درصد سطح برگ آلوده و مساحت لکه درنژادهای IA-90, IA-82 نشان دهنده سهم بالای اثرات ژنی غالبیت در کنترل این صفت بوده است.
با توجه به نتایج بدست آمده روشهای اصلاحی بک کراس و RFLP مناسب ترین روش برای بهبود مقاومت به این بیماری در ارقام والد و ترکیبات هیبریدی برنج توصیه می گردد.

1 مقدمه
برنج یکی از مهمترین منابع غذایی مردم جهان بوده بطوریکه 3/2 کیلوکالری انرژی مورد نیاز مردم آسیا            و 3/1کیلو کالری مورد نیاز مردم آمریکای جنوبی و آفریقا از این محصول تأمین می شود. این گیاه مناسب کشت در مناطق گرم و مرطوب بوده و سطح زیر کشت آن در جهان بالغ بر 146 میلیون هکتار و تولید آن بیش از 520 میلیون تن در سال می باشد برنج در ایران بر اساس آمار سال 1382 در سطحی حدود 611000 هکتار کشت شده و میزان تولید آن درسال حدود 3300000 تن شلتوک بوده است(آمار و فن آوری اطلاعات- بانک اطلاعات زراعت-1382).
ایران تنها 4/0% مساحت زیر کشت برنج جهان را در اختیار دارد که تقریباً 75% آن در استانهای گیلان، مازندران و گلستان می باشد (آمار و فن آوری اطلاعات- بانک اطلاعات زراعت-1382). برنج در رژیم غذایی مردم ایران اهمیتی ویژه دارد و آن را بصورت های مختلف در برنامه غذایی خود استفاده می کنند. با رشد جمعیت       و تغییر ذائقه مردم در گرایش به برنج میزان مصرف آن نیز همچنان در حال فزونی میباشد، و با این روند احتمال می رود که در سالهای آتی به عنوان منبع اصلی تأمین کالری مردم ایران مورد توجه قرار گیرد. این محصول در حال حاضر به عنوان یکی از اقلام وارداتی مهم در بین انواع مواد غذایی به شمار می رود، تلاش جهت حصول خودکفایی در تولید برنج  و کاهش واردات این محصول مهم یکی از اهداف دولت می باشد که انشاءالله با سعی و تلاش فراوان رسیدن به این هدف میسر خواهد شد. تولید برنج در مناطق مختلف اغلب مواجه با تنش های زنده و غیر زنده می باشد. عواملی مثل آفات، علف های هرز، عوامل بیماری زا، قدیمی بودن ادوات مورد استفاده در تبدیل و عوامل اقلیمی نامساعد در طول فصل عملکرد نهایی محصول را تحت تأثیر قرار می دهند. عامل بیماری بلاست برنج مهمترین بیمارگر قارچی  برنج در سطح دنیاست،که اغلب یک محدودیت مهم در تولید برنج در نواحی گرمسیری و همچنین معتدله به شمار می رود. هر چند برآورد قابل اعتمادی ازکاهش محصول توسط این بیماری در ایران صورت نپذیرفت  ولی سالیانه درصد بالایی از محصول تولیدی برنج به علت کاشت ارقام محلی خوش طعم و بو که اغلب حساس به این بیماری می باشند از بین می رود. از آنجایکه بررسی و تحقیق پیرامون ارزیابی اجزاء مقاومت  به بلاست و چگونگی پیشرفت بیماری در مراحل مختلف رشدی ارقام برنج در مراحل اولیه می باشد. لذا هدف از این تحقیق ادامه مطالعات در این رابطه بوده و همچنین اهداف ذیل نیز مورد توجه می باشند:
1- اندازه گیری و تعیین اجزای تنوع ژنتیکی برای مقاومت به بیماری بلاست برگ برنج در ارقام برنج
2- بررسی وضعیت توسعه بیماری در ارقام و تلاقی های (نسل  F1 )تحت مطالعه
 
1-2) بررسی منابع
1-2-1) گیاهشناسی و ریخت شناسی برنج:
گیاه برنج از شاخه نهاندانگان، رده تک لپه ای، راسته گل پوشینه ایها، تیره گندمیان  یا چمنیان و جنس اورایزا  می باشد. گیاهی یکساله، ریشه های آن افشان و قوی بوده و ساقه تو خالی، استوانه ای و صاف است. در روی ساقه تعدادی گره که ممکن است بین 20- 10 عدد تغییر کند وجود دارد. گره ها و میانگره ها توسط غلاف احاطه می شوند. هر بوته برنج معمولاً 4 تا 5 پنجه تولید می کند ارتفاع بوته برنج 50 تا 150 و گاهی 200 سانتی متر تغییر می کند. مانند تمام گیاهان خانواده غلات، در برنج نیز برگها بصورت یک در میان و بطور متناوب در طول ساقه قرار دارند. گل آذین در برنج از نوع خوشه سنبله (پانیکول) بوده که در انتهای ساقه قرار دارد (خدابنده 1371, نصیری 1376, نوروزی و عارفی 1376). اجزای اصلی خوشه شامل قاعده خوشه، محور،انشعابات اولیه و ثانویه دمگل،گلوم های تکامل نیافته و سنبلچه      می باشند. سنبلچه بر روی دمگل تشکیل می گردد هر گل بوسیله لما و پالئا که ممکن است ریشکدار یا فاقد ریشک باشد احاطه می گردد.گل شامل مادگی،پرچمها و لودیکولها می باشند مادگی شامل کلاله و خامه و تخمدان است. کلاله پر مانند             و دوشاخه می باشند تعداد پرچمها در برنج بر خلاف سایر غلات شش عدد می باشد، برنج گیاهی خود گشن      و حدود نیم درصد دگرگشن است گلدهی یک خوشه در طی یک دوره10-7روزه انجام می گیرد
(مامقانی 1381, یزدی صمدی و عبدمیشانی 1371, پولمن 1987) ازنظرمورفولوژی مراحل رشدبرنج رابه چندفازتقسیم کرده اند:
الف) مرحله رویشی که شامل جوانه زدن، نشاء و مرحله پنجه دهی می باشد.

دانلود مقاله جامع بیماری های ژنتیکی

اختصاصی از یارا فایل دانلود مقاله جامع بیماری های ژنتیکی دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .

فرمت فایل : word(قابل ویرایش)

تعداد صفحات:82

فهرست مطالب:

مقدمه
معرفی علم ژنتیک
جهش
انواع جهش ها
جهش های خودبخودی و جهش های القایی :
اثر جهش های کوچک بر فراورده ژن :
در مورد جهش های حذف و اضافه نیز دو حالت می توان انتظار داشت :
جهش های ساختاری و جهشهای تنظیم کننده :
ترمیم :
مرور فصل
تالاسمی
هموگلوبین
تالاسمی:
انواع تالاسمی
تالاسمی ماژور
آلفا تالاسمی
سیستیک فایبروزیز:
فنیل کتونوریا چیست؟   
تشخیص:
هموفیلی چیست؟
کمک به بیماران هموفیل:
بیماری سندرم داون
علت بروز سندرم داون :

علایم سندرم داون:
عوارض جانبیآمنیوسنتز

بیماری کم‌خونی داسی‌ شکل چیست؟
شایعترین انواع ژن سلول داسی :
صفت سلول داسی:
چه کسی به بیماری سلول داسی مبتلا می‌شود؟
علل بیماری داسی شکل چیست؟
علائم بیماری سلول داسی شکل چیست؟
-    آنمی :
-    سندروم قفسه سینه حاد:
-    کم خونی مگالوبلاستیک یا فقر ویتامین:
بیماری سلول داسی شکل چگونه تشخیص داده می‌شود؟

  آلکاپتونوری
  مشاوره ژنتیک
مراحل فرآیند PGD:
ارزیابی ژنتیکی
ریسک فرآیند PGD
نحوه ی انجام PGD:
•    FISH
•    PCR
•    هاپلوتایپ
PGD برای چه کسانی توصیه می شود؟
منابع :

همراه با اشکال و جدول

مقدمه:
علم ژنتیک یکی از شاخه‌های علوم زیستی است که بوسیله قوانین و مفاهیم موجود در این علم می‌توانیم به تشابه یا عدم تشابه دو موجود نسبت به یکدیگر پی ببریم و بدانیم که چطور و چرا چنین تشابه و یا عدم تشابه در داخل یک جامعه گیاهی و یا جامعه جانوری ، بوجود آمده است. علم ژنتیک علم انتقال اطلاعات بیولوژیکی از یک سلول به سلول دیگر ، از والد به نوزاد و بنابراین از یک نسل به نسل بعد است. ژنتیک با چگونگی این انتقالات که مبنای اختلالات و تشابهات موجود در ارگانیسم‌ها است، سروکار دارد. علم ژنتیک در مورد سرشت فیزیکی و شیمیایی این اطلاعات نیز صحبت می‌کند.
علم زیست شناسی ، هرچند به صورت توصیفی از قدیمی‌ترین علومی بوده که بشر به آن توجه داشته است. اما از حدود یک قرن پیش این علم وارد مرحله جدیدی شد که بعدا آن را ژنتیک نامیده‌اند و این امر انقلابی در علم زیست شناسی بوجود آورد. در قرن هجدهم ، عده‌ای از پژوهشگران بر آن شدند که نحوه انتقال صفات ارثی را از نسلی به نسل دیگر بررسی کنند. ولی به دو دلیل مهم که یکی عدم انتخاب صفات مناسب و دیگری نداشتن اطلاعات کافی در زمینه ریاضیات بود، به نتیجه‌ای نرسیدند.
اولین کسی که توانست قوانین حاکم بر انتقال صفات ارثی را شناسایی کند، کشیشی اتریشی به نام گریگور مندل بود که در سال 1865 این قوانین را که حاصل آزمایشاتش روی گیاه نخود فرنگی بود، ارائه کرد. اما متاسفانه جامعه علمی آن دوران به دیدگاهها و کشفیات او اهمیت چندانی نداد و نتایج کارهای مندل به دست فراموشی سپرده شد. در سال 1900 میلادی کشف مجدد قوانین ارائه شده از سوی مندل ، توسط درویس ، شرماک و کورنز باعث شد که نظریات او مورد توجه و قبول قرار گرفته و مندل به عنوان پدر علم ژنتیک شناخته شود.
در سال 1953 با کشف ساختمان جایگاه ژنها از سوی جیمز واتسون و فرانسیس کریک ، رشته‌ای جدید در علم زیست شناسی بوجود آمد که زیست شناسی ملکولی نام گرفت . با حدود گذشت یک قرن از کشفیات مندل در خلال سالهای 1971 و 1973 در رشته زیست شناسی ملکولی و ژنتیک که اولی به بررسی ساختمان و مکانیسم عمل ژنها و دومی به بررسی بیماریهای ژنتیک و پیدا کردن درمانی برای آنها می‌پرداخت ، ادغام شدند و رشته‌ای به نام مهندسی ژنتیک را بوجود آوردند که طی اندک زمانی توانست رشته‌های مختلفی اعم از پزشکی ، صنعت و کشاورزی را تحت‌الشعاع خود قرار دهد.  

معرفی علم ژنتیک
ژنتیک، علم مطالعه وراثت، در تمامی زمینه‌های آن، از گسترش صفات در یک شجره‌نامه خانوادگی، تا بیوشیمی ماده ژنتیکی، اسید دزوکسی ریبونوکلئیکDNA و اسید ریبونوکلئیکRNA است. هدف ما در این بخش، معرفی و بررسی مکانیزم‌های وراثت است.
به صورت تاریخی، ژنتیک دانان در 3 حیطه مجزا فعالیت کرده‌اند، هر حیطه با مشکلات، روش‌ها و موجودات زنده مورد مطالعه مربوط به خود. این 3 حیطه عبارتند از ژنتیک کلاسیک، ژنتیک مولکولی و ژنتیک تکاملی (یا ژنتیک جمعیت
در ژنتیک کلاسیک ما با تئوری کروموزومی وراثت روبرو هستیم، مفهومی که ژن‌ها را به صورت خطی در کنار هم بر روی کروموزوم فرض می‌کند. موقعیت نسبی ژنها با بررسی فراوانی زاده‌های حاصل از آمیزش‌های خاصی قابل تعیین است. ژنتیک مولکولی مطالعه ماده ژنتیک است؛ ساختار، رونویسی و بیان ماده‌ ژنتیک. همچنین در همین حیطه ما انقلاب بزرگ تکنولوژی DNAنوترکیب (یا مهندسی ژنتیک) و اطلاعات بدست آمده از آن را بررسی خواهیم کرد. ژنتیک تکاملی یا ژنتیک جمعیت به بررسی تغییرات در فراوانی ژنها در جمعیت می‌پردازد. مفهوم داروینی تکامل که بنابر پایه انتخاب طبیعی است بررسی  می‌شود.

مقاله کاربرد الگوریتم ژنتیکی سازگار یافته برای مسائل دینامیکی چند هدفه

اختصاصی از یارا فایل مقاله کاربرد الگوریتم ژنتیکی سازگار یافته برای مسائل دینامیکی چند هدفه دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .

فرمت فایل : word(قابل ویرایش)

تعداد صفحات:24

فهرست مطالب:

خلاصه :
1-     مقدمه
1-1-    معرفی ها
2-1- نسبت دهی لیاقت و ماندگاری واگرایی
3-1- توضیح صورت مسئله
2-    بهینه سازی چند هدفه
2-1- توضیح در مورد فرمولبندی مسئله
2-2- الگوریتم ژنتیکی قرار دادی ما تابع لیاقت وزنی استاتیک
3-2- الگوریتم ژنتیکی سازگاری یافته با تابع لیاقت وزنی قانونمند
3- نتایج و بحث

خلاصه :

این مقاله یک الگوریتم ژنتیکی سازگار (AGA) را همراه با تابع لیاقت دینامیکی، برای مسائل چند هدفه (MOPs) در محیط دینامیکی تشریح می کند. به منظور دیدن اجرای الگوریتم، این روش برای دو نوع از مسائل MOPs بکار گرفته شده است. اولا این روش برای پیدا کردن آرایش نیروهای نظامی برای شبیه سازی رزمی بکار گرفته شده است. این مقاله در مورد چهار تابع هدف بحث می کند که باید بهینه شوند و یک واسطه فازی را ارئه می دهد که طرح جامعی را از چهار تابع هدف می سازد. دومین واسطه فازی برای کنترل نرخ عملکردهای تقاطع (Crossover) و جهش (Mutation) بکار گرفته می شود که بر اساس خواص آماری لیاقت (Fitness) جامع می باشد.

علاوه بر مسئله آرایش نیروهای نظامی یک مثال ساده از بهینه سازی چند هدفه که توسط فرینا و همکارانش گشته نیز ارائه شده است و توسط این الگوریتم پیشنهادی حل شده است. نتایج بدست آمده در اینجا نشان می دهد که الگوریتم ژنتیکی افزایش یافته، نسبت به الگوریتم ژنتیکی معمولی، عملکرد بهتری در مورد همگرائی دارد.

کلمات کلیدی:

الگوریتم ژنتیکی سازگار یافته ، منطق فازی ، آرایش نیروهای نظامی ، شبیه سازی رزمی و بهینه سازی چند هدفه .

• مقدمه

بدیهی است که حالتهای متعددی برای مسائل عملی بهینه سازی وجود دارد که در ابتدا، بهینه سازی چندین اندازه گیری اجرا (MOP) یا محک ، غیر قابل اجتناب است و این اندازه گیری ها ممکن است که با هم تداخل هم داشته باشند. مسائل مربوط به MOPsمی توانند استاتیکی یا دینامیکی باشند. مهمترین موضوع در حل این گونه از مسائل عبارت از مشخص کردن توابع هدف طراحی، برای اینکه خوبی (Goodness) یک حل مشخص بر آورد شود. در مسائل MOPs بجای یک حل بهینه ، یک مجموعه از حل های بهینه ( مجموعه بهینه پارتو )، بسته به وجود چند تابع هدف، رخ می دهد. بدون تنزل یکی از جوابها ، هیچ بهبودی برای هر یک از حلهای بهینه پارتو وجود ندارد. هیچ حل پارتو نمی تواند از حل دیگری بهتر باشد مگر اطلاعات بیشتری را در اختیار داشته باشیم . برای اینکه انتخاب نهایی بهتری داشته باشیم ، بهترین راه این است که تا جایی که ممکن است حلهای مختلف بهینه پارتو را بدست آوریم.

در بعضی از کاربردهای جهانی نظیر حمل ونقل باربا روباتها ، مشخص کردن مدل و طراحی کنترل کننده ها ، مسائل محیطی و نیازهای MOPs بصورت دینامیکی تغییر می کنند و برای اینگونه کاربردها ، بهینه سازی چند هدفه وابسته به زمان، نیاز است . در این گونه از مسائل ، توابع هدف مربوطه و قیود و پارامترهای مسئله یا همه اینها، ممکن است لحظه به لحظه تغییر کنند. این گونه از مسائل MOPs دینامیکی نامیده می شوند. در این حالتها ، بهینه سازی تابع باید در بازه های زمانی خیلی محدود شده انجام پذیرد.

دانلود تحقیق الگوریتم های ژنتیکی به کاربره شده در مدیریت ترافیک هوایی

اختصاصی از یارا فایل دانلود تحقیق الگوریتم های ژنتیکی به کاربره شده در مدیریت ترافیک هوایی دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .

فرمت فایل : word(قابل ویرایش)

تعداد صفحات:25

چکیده:

افزایش ترافیک هوایی، از زمان شروع تجارت هوایی، باعث مشکل اشباع در فرودگاهها، یا مکانهای فضایی شده است. در حالی که هواپیماها ارتقاء می یابند و اتوماتیک تر می شوند. اما هنوز کنترل ترافیکی بر پایه تجربیات انسان است. مطالعه حاضر ، دو مشکل مدیریت ترافیک هوایی (ATM) را به جزء بیان می کند، که برای آنها راه حل های بر پایه الگوریتم ژنتیکی وجود دارد. اولین کاربرددر رابطه با مشکل enroute است و دومین کاربرد در مورد مشکلات مدیریت ترافیکی در سکوهای فرودگاهها است.
9.1) راه حل درگیریهای Enroute = کنترل ترافیک هوایی (ATC) می تواند توسط یک سرس از فیلترها نشان داده شود، جایی که هر فیلتر یک ؟ خاص دارد و افق های خاص محیطی و موقتی را اداره می کند. 5 سطح (لِوِل) قابل تشخیص است. در دوره طولانی (بشتر از 6 ماه) ترافیک در یک روش میکروسکوپی می تواند برنامه ریزی شود. برای مثال مردم با یک نمودار ترافیکی روبرو هستند که اندازه های کمیته ، که برنامه های ساعتی و موافقت با ارتش را مورد توجه قرار داده است، به کاربرده می شود برای فرهنگ هواپیمایی در زمانهای اوج یعنی بعد ظهر جمعه.
در دوره کوتاهتر ، معمولاً در مورد تنظیمات قبل ، صحت می شود. این مورد شامل برنامه ریزی کردن روز ترافیک ، یک یا دو روز قبل تر می شود. در این مرحله ، اشخاص ایدة مشخصی درباره بیشتر برنامه ی پرواز و ظرفیت کنترل هر مرکز دارند. حداکثر جریان هواپیما که می تواند یک قطر را سوراخ کند. ظرفیت قطر نامیده می شود. این عمل توسط CFMU3 انجام می شود. ترافیک میان آتلانتیک برای مثال در این مرحله مورد توجه قرار می گیرد. راههای هوایی، تنظیم ساعت های پرواز و حالت هوا مورد توجه قرار می گیرد. به طور کل این شغل توسط FMP4 در هر مرکز صورت می گیرد. آخرین فیلتر ، فیلتر تاکتیکال است که با کنترل داخل یک قطر بستگی دارد. زمان متوسطی که یک هواپیما در یک بخش صرف می کند حدود 15 دقیقه است. اینجا میزان رویت کنترل کننده کمی بالاتر از میزان دریافت طرحهای پرواز است چند دقیقه قبل از ورود هواپیما به بخش. کنترل کننده وظیفه چک کردن، حل اختلافات و همپایه بودن با بخش های همسایه را تضمین می کند. در این حالت تعیین تعریف برخورد مطلوب است. دو هواپیما با هم برخورد دارندوقتی که فاصله جدایی افقی بین آنها کمتر 5 مایل باشد و تفاوت انها در ارتفاع کمتر از 1000 فیت باشد. روش هایی که توسط کنترل کننده برای حل این برخورد به کار می رود بر پایه مسائل زیر است.
بر روی تجارب قبلی و هر دانش خلاقی. وقتی که چند جفت از هواپیماها در اختلاف مشابهی با هم تماس دارند، آنها با ساده کردن مشکلات شروع می کنند که فقط اختلافات ابتدایی را داشته باشند.
برای حل فیلتر اضطراری به نظر نمی رسد که مداخله کند به جز مواردی که سیستم کنترل دچار نقض شده یا اینکه ضعیف شده است. برای کنترل کننده ، آشیانه اطمینان مسیر هر هواپیما را با افق موقت چند دقیقه ایی پیش بینی می کنند. از موقعیت های رادار و الگوریتم های ادامه دار استفاده می کند و یک اخطار را در لحظه برخورد بوجود می آورد. این یک راه حلی را برای برخورد پیشنهاد نمی کند. به طور کل TCAS به نظر می رسد که از چنین تصادفی جلوگیری کند. پیش بینی موقت کمتر از یک دقیقه است (بین 25 تا 40 ثانیه) بنابر این بسیار دیر است برای کنترل کننده مانور هواپیما را، همانطور که تخمین زده شده که نیاز به حداقل زمان 1 تا 2 دقیقه برای آنالیز کردن موقعیت دارد راه حلی را پیدا کنند و آنرا به هواپیماها اطلاع دهند. به طور عمومی TCAS، هواپیمای اطاف را جستجو می کند و به خلبان برای حل برخورد پیشنهاداتی می کند. این فیلتر باید برخورد غیر قابل پیش بینی را حل می کند، برای مثال وقتی که یک هواپیما از سطح پرواز خود بالاتر رفته است یا یک مشکل تکنیکی که به طور قابل توجهی ارتفاع آنرا پایین آورده است. کاربردهای پیشنهاد شده در این بخش با فیلتر تاکتیکال ارتباط دارند: دانستن موقعیت هواپیما در لحظه حاضر و موقعیت بعدی آنها، را بوجود نمی آورد. راه حل برای پایه چندین تصور است. یک هواپیما نمی تواند سرعت خود را تغییر دهد (یا بسیار آرام باید این کار را بکند) مگر در مواقع فرود. نباید اینطور تصور شود که یک هواپیما با سرعت انی پرواز می کند، به غیر مواردی که سطح بندی می شود و هیچ بادی وجود ندارد. به علاوه در طول فرود و بلند شدن ، مسیر آن یک خط صاف نیست. هواپیماها در مسیر چرخش خود در فشار هستند. به طور عمومی خلبانها مانور افقی را به عمودی ترجیح می دهند مگر در هنگام بلند شدن یا نشستن. اگر چه امروزه خلبانهای اتوماتیک قرتمندتر از خلبانهای انسانی هستند (در موقعیت های نرمال پرواز) برای مواقعی که حقیقی به نظر می رسد توجه کردن به این مسیرها که توسط انسانها قابل دسترسی نیست.
خلبان. نامطمئنی بین سرعت فرود آمدن و بلند شدن بسیار زیاد است (بین 10% و 50% سرعت عمودی). در طول مسافرت ، نااطمینانی در سرعت کاهش می یابد. بعد از آن ، نا اطمینانی به همراه گذشت زمان بیشتر نمی شود، همانطور که یک هواپیما، ارتفاع خود را کاملاً خوب نگه داشته است. تقریباً غیر ممکن است که به دنبال راه حل های آنالیتکی برای حل مشکل برخورد باشیم . اما، اصلی ترین مشکل از پیچیدگی مشکل بوجود می آید. بخش اول این فصل ، به معرفی بعضی از توضیحات می پردازد که حل مشکل برخورد برای ما قابل فهم تر می کند و بخش دوم به تاریخچه ایی کوتاه از الگوریتمهای آزمایش شده برای این مشکل و محدودیتهای آن می پردازد. قسمت سوم مدلهای مشکل را به جزء بررسی می کند و پیشرفت الگوریتم ژنیتکی برای حل مشکل در بخش چهارم وجود دارد که با آمارهای ؟ بدست آمده دنبال می شود.
1.1.9) پیچیدگی حل مشکل برخورد= یک برخورد را می توان به صورت زیر توضیح داد:
یک برخورد یعنی برخوردی بین دو هواپیما در طول یک زمان داده شده از مسیر پیش بینی شده، گرفتن نااطمینانیها در مسیر.
کلاسهای معادل مربوطه به عنوان دسته و مجموعه برخورد هواپیما یا مجموعه ایی از اندازه n می تواند شامل شود به برخوردهای قوی n. توجه کردن به فقط هواپیمای افقی ، نشان می دهد که تمام راه حل های قابل قبول شامل 2n(n-1) اجزای مرتبط، تحت این تصور که یک متر مناسب به کاربرده شده که نیاز دارد به اجراهای زیادی از الگوریتم جستجو بنابر این برای مجموعه هواپیمای 6،32768 عضو متصل پیشنهاد می شود. در حقیقت اگر عملکرد هواپیما مورد توجه قرار گیرد، تمام اجزای مرتبط لازم نیست که مورد بررسی قرار گیرد. با آرام کردن محدودیت های جدا کننده، مشکل شبیه یک مشکل جهانی می شود که حداقل شامل بهینه های داخلی می شود مانند اجزای متصل. اضافه کردن بعد عمودی خصوصیت ترکیبی مشکل را کم نمی کند.
2.1.9) وجود مترهای حل کننده:
اولین پروژه اتوماتیک کنترل ترافیک ، آمریکایی بود و در شروع دهه 80 بوجود امد، اما قادر به حل مجموعه سایز 3 یا بیشتر نبود. پروژه اروپایی ARC2000 یک متر از نارساییهای ممتر لوله چهار بعدی را پیشنهاد کرد که مسیر n+1+h هواپیما در محیط n که قبلاً مسیرش محاسبه شده بود. ارتقاء دهد.
این مدلها شکیات را مورد توجه قرار ندادند و قادر نبودند با حجم عظیم ترافیک مواجه شوند. در نهایت پروژه تجربی اروپایی FREER در سال 1995 کامل شد. و پیشنهاد کرد که می تواند برخورد هواپیماها را حل کند. مشکل همپایه بودن بین هواپیماها با به کار بردن قوانین قبلی هدایت می شد ، که مانند استفاده کردن از ؟ تکراری مانند ARC2000 بود، که قادر به مواجه شدن با مجموعه های بزرگتر نبود.
روش های تئوری : در میان تئوریهای به کار برده شده برای حل مشکل ، ما ابتدا می توانیم به تکنیک های Zeghal اشاره کنیم. با توجه به این روش، هواپیما توسط اهدافش جذب می شود و توسط هواپیمای نزدیک برگردانده می شود. متد وقتی که تراکم کم است، خوب عمل می کند، اما وقتی ترافیک زیاد است بهم ریخته عمل می کند. به علاوه ، مدل تصور می کند که پروازها کاملاً اتوماتیک هستند، همانطور که مسیرها می توانند دائماً تغییر یابند. روش های مشابه که از زمینه های قوی استفاده می کردند توسط عدم هوانوردی سازمان Berkeley آزمایش شد، اما در آن زمان آنها قادر به حل بیشتر از سه مجموعه هواپیما نبودند. این روش بسیار شبیه بود به عملکرد نشان داده شده توسط شبکه هایی که مترهای آزمایش بر پایه LOG (CENA-ENAC) بودند که نمی توانستند به مجموعه های پیچیده افزایش یابند. بلاخره ، میان روش های جهانی برای مجموعه های پیچیده، اولین کار اصلی توسط (فردن)Feron  انجام شد. او از برنامه های معین برای تعیین کردن مسیر راه حل برای هر جفت از هواپیماهای برخوردشده استفاده کرد: پس یک متد ارتقاء دهنده محدب که شامل محدودیت های محدب می شد به کار برده شد برای محاسبه کردن مانور. به هر حال این روش در تمام موارد راه حل قابل قبولی را ارائه نمی داد. اضافه کردن صدای رَندُم به پیشرفت سرعت موفقیت کمک کرد. محدودة سادة مدل انتخاب شده، محدودة کوچکی را برای کاربرد موفق آن در موقعیت های پیچیده فراهم کرد. در نهایت LOG محدودیت ها و شاخه های فاصله را آزمایش کرد، که می توانست مشکل را در دسته های کوچک حل کند. اما قادر در نبود آن را برای دسته های بیشتر گسترش دهد. تا این تاریخ فقط الگوریتم ژنتیکی توانست مجموعه های بزرگ را در زمان قابل قبول حل کند .
3.1.9) مدل کردن مشکلات با توجه به شبهات:
اول از همه یک زمان جستجو TW توضیح داده می شود و یک تقلید کننده موقعیت آیندة هواپیما را در قالب زمان ارزیابی می کند. این تقلید کننده شبهات در سرعت افقی و عمودی هواپیما را مورد توجه قرار می دهد همانطور که در شکل 1-9 نشان داده شده است. در هواپیمای افقی ، هواپیما توسط یک نقطه در لحظه شروع ارائه می شود. در مدت زمانع این نقطه ، بخشی می شود که در طول آن به طور افزایش ادامه می یابد. وقتی مسیر عوض می شود (t=4 در) بخش ناقض می شود در حالی که مسیر (بردار) جدید سرعت را دنبال می کند. هواپیما پس توسط یک شکل چهار گوش هواپیمانشان داده می شود. به کار بردن یک تغییر جدید (t=7 در) شکل چهار گوش هواپیما را به شش گوش تغییر می دهد و به تعبیر عامتر به بردار (مسیر). در هواپیمای عمودی یک سیلندر می تواند توضیح داده شود که ارتفاع آن با زمان افزایش می یابد. وقتی که هواپیما به سطح مطلوب پرواز می رسد (t=8 در) بالای سیلندر ، ارتفاع آنرا دیگر تغییر نمی دهد و انتهای سیلندر شروع به بالا رفتن می کند، تا زمانی که سطح پرواز می رسد.
جستجو برخورد:
برای جستجوی برخوردهای قوی بین هواپیماها ، لازم است که در هر زمان، فاصله افقی بین مسیرها و فاصله عمودی بین سیلندرهایی که دو هواپیما را نشان می دهد، اندازه بگیریم. برخورد وقتی اتفاق می افتد که استاندارهای عمودی و افقی به طور همزمان ؟ می کنند.
مدل کردن مانور برای اجتناب:
برای احترام گذاشتن به هر دو خلبان و نحوه انجام هواپیماها مانور ساده ایی را توضیح می دهیم: در هواپیمای افقی، مانور یک تغییر بالایی از 10 و 20 تا 30 درجه به راست و یا چپ است ، که در زمان t=0 شروع می شود و در زمان t=1 تمام می شود. در هواپیمای عمودی مانور پیشنهاد می کند با توجه به حالت پرواز که در آن حالت هواپیما قرار دارد. بنابر این همانطور که در شکل 9.2 نشان داده شده، وقتی هواپیما بالا می رود، می تواند بالا رفتن خود را در t=0 نگه دارد و دوباره آنرا در t=1 شروع کند. در حالت گردش و سفر ، می تواند به پایین ترین سطح پرواز پایین آید (1000 فیت پایین) در زمان t=0 و به اولینسطح پرواز در زمان t=1 بپیوندد. وقتی هواپیما بیشتر از 50 نُتیکال از فرودش ، پایین تر است ، می تواند فرودش را در زمان t 0  پیش بینی کند و فرود را در زمان t1 نگه دارد که به مسیر فرود خود بپیوندد. برای اینکه مانور قابل بدست آوردن باشد فقط یک مانور در هر زمان به خلبان داده می شود. مانور جدید فقط وقتی به او پیشنهاد می شود که اولید مانور تمام شده باشد. بنابر این یک مانور توسط گونه مدل می شود. نوع اول عینی است که نوعی از مانور را نشان می دهد (درجه 30-و20- و10-.30 و20 و10 ) یا مانور عمودی دو نوع دیگر t0 وt1 انواعی هستند که شروع و پایان مانور را نشان می دهند.
مدیریت زمان واقعی:
راه حل انجام می شود در زمان پیش بینی شده TW (بین 10 تا 15 دقیقه) و موقعیت هر ؟ دقیقه Updeate می شود (2 تا 3 دقیقه در عمل). شکل 3-9 مدل زمان واقعی را نشان می دهد. سه دور در محدودة زمانی وجود دارد. نوع اول، طول زمان؟ دقیقه است که زمان قفل شده نامیده می شود. هیچ تغییر مسیری در این دوره صورت نمی گیرد. در حقیقت در طول مدت لازم برای تخمین زدن موقعیت هواپیما پرواز خود را ادامه می دهد. بنابر این تغییر مسیر ممکن نیست. دورة بعدی دورة نهایی نامیده می شود، برای اینکه ترتیب مانور نمی تواند در طول تکرار بعدی تغییر یابد. آخرین دوره، دورة مانور پیش بینی شده است. این می تواند در طول تکرار بعدی در نظر گرفته شوند.